Bulletin épidémiologique du 28 juin au 4/07/21 (Du côté de la Science)

"Résumé de la situation actuelle : Inversion de tendance – Le nombre de cas repart à la hausse et la primo-vaccination continue de stagner

Les indicateurs épidémiologiques connaissent une inversion de tendance ou un ralentissement de la décroissance enregistrée depuis des semaines. Au niveau national les indicateurs hospitaliers évoluent toujours à la baisse, mais moins rapidement. Au 04/07, les hospitalisations en cours s’élèvent à 8 986 (-11,9 % vs. -14,6% au 27/06). Les soins critiques en cours s’élèvent à 1 104 (-17,9% vs. -21,0% au 27/06). On note un ralentissement de la diminution des nouvelles admissions hospitalières.

●193 nouveaux décès hospitaliers ont été enregistrés durant la semaine. 17 décès en EHPAD ont été rapportés, La décroissance du nombre hebdomadaire des décès connaît un net ralentissement (-16,8% contre -33,3% la semaine précédente).

●L’incidence s’élevait à 21,5 au 01/07 au niveau national en semaine glissante. Si elle est orientée à la hausse, la situation est contrastée selon les départements et les tranches d’âges, avec des évolutions erratiques du fait de l’émergence de foyers de contamination (clusters), tandis qu’une diffusion plus communautaire est signalée dans certains territoires par Santé Publique France. Le taux de positivité après avoir touché un plus bas à 0,6%, semble repartir à la hausse à 0,8%.

●Au 01/07, 4 départements ont une incidence sur 7 jours supérieure à 50, dont 2 supérieure à 100 (la Guyane et La Réunion). L’évolution de l’incidence est orientée à la hausse dans 41 des départements de la métropole. Cette hausse est encore plus marquée dans les classes d’âge les plus vectrices : 20-29 ans et 30-39 ans.

●Au cours de la semaine calendaire, le rythme de la primo-vaccination a continué de ralentir. Seulement 1 117 629 personnes ont reçu au moins une première dose de vaccin, soit -12,6% par rapport à la semaine précédente. 3 126 105personnes ont été complètement vaccinées, soit 5,5% de plus que la semaine précédente.

●Depuis le début de la vaccination, 51,5% de la population ont reçu au moins une dose et 36,4% ont été complètement vaccinés. 85,4% des 70 ans et plus ont reçu au moins une dose, 78,5% sont complètement vaccinés.

●Les données de suivi des mutations des variants sont désormais disponibles sur Géodes, le site de géo-données de Santé Publique France. Au 02/07, la mutation L452R dans les tests positifs criblés s’élevait à 39,7%, la mutation E484K à 20,0%, et la mutation E484Q à 0,8%. Le taux de tests positifs criblés s’élevait à seulement 43%

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Le criblage n’est effectué à l’heure actuelle que sur 43% des cas positifs pour identifier les cas non Alpha.Le variant Kappa, E484Q, est faiblement présent en France et n’est retrouvé que dans une dizaine de départements.Les variants Beta, Gamma ou Eta sont très majoritaires en Guyane et à la Réunion, et on retrouve également une présence marquée dans le nord-est de la France. Les variants Delta, Kappa et Epsilon (majoritairement Delta, vu la faible prévalence de la mutation E484Q) sont présents sur quasiment l’ensemble de la France métropolitaine, en particulier dans deux départements du Grand-Est, mais également dans le Sud-Est, et dans les Landes. L’évolution hebdomadaire des ces indicateurs sera à suivre dans les prochaines semaines, mais la situation chez nos voisins indique que le variant Delta deviendra probablement majoritaire sur l’ensemble du territoire métropolitain avant la fin du mois de juillet

+ carte de la présence des mutations par département.